昆明醫科大學第二附屬醫院建于1952年，原名“昆明市工人醫院”，1962年更名為昆明醫學院第二附屬醫院，2000年成立昆明醫學院第二臨床醫學院，2012年更名為昆明醫科大學第二附屬醫院，現已發展成一所科室齊全、名醫薈萃、設備精良、技術力量雄厚的集醫療、教學、科研、預防、保健為一體的大型綜合性三級甲等醫院，是“全國百佳醫院”及國際緊急救援中心（SOS）網絡醫院，是人力資源和社會保障部、全國博士后管理委員會批準認定的博士后科研工作站。建院以來，昆明醫科大學第二附屬醫院一直尊崇“明德至善”的院訓，倡導家園意識和“關愛生命，情系患者，誠信友愛，和諧發展”的價值觀，始終堅持“以病人為中心，以提高醫療、教學、科研質量為根本，與人民健康同行”的宗旨，為增進人民健康，促進云南社會經濟發展，維護邊疆和諧穩定做出了突出貢獻。
　　醫院規模宏大，地處昆明西園路與滇緬公路交匯處，占地面積達101.05畝，總建筑面積25余萬平方米。醫院新建成投入使用的綜合大樓涵蓋門診、急診（化學中毒醫療救治基地）、住院、教學、科研、后勤服務、地下停車場等用房，配置有公共商業區，設有景致怡人的屋頂花園、空中花園及環境優美的室外景觀綠化，總體布局體現了現代化醫院的理念，病區、診室設計、醫療流程按照與國際接軌的現代醫院標準設置并與未來醫學教育發展相適應，充分體現了“以病人為中心”及“以人為本”的理念。醫院配置有現代醫療信息化、智能化管理系統，先進的手術室凈化系統、全自動檢驗系統、高效的軌道物流系統、全空調、強制循環熱水系統及垂直交通系統及靜脈用藥集中調配中心（PIVAS），強大而全面的綜合服務功能充分滿足了不同層次患者的就醫需求，全面提升患者良好的就醫感受。
　　人才濟濟，技術力量雄厚。醫院現有在崗職工2500余人，醫院有云南省首屆“興滇人才獎”1人”，國家“百千萬人才”2人，云南省首批“云嶺名醫”4人，衛生廳首批“十百千人才計劃領軍人才”1人（外科學），學科帶頭人11名，云南省中青年學術和技術帶頭人6人、后備人才6人，享受國務院特殊津貼16人，獲云南省有突出貢獻的優秀專業技術人才16人，享受省政府特殊津貼16人，獲全國醫院優秀院長2人，獲全國“五一勞動獎章”1人，獲“全國衛生系統先進工作者”稱號2人，全國教育系統先進個人1人。
　　科室齊全，學科優勢突出。醫院設有1個省級專科醫院（云南省泌尿專科醫院），67個臨床和醫技科室，有2個國家臨床重點專科建設項目（重癥醫學、泌尿外科），10個省級臨床重點專科建設項目（護理專業、燒傷專業、神經內科專業、兒科專業、消化專業、骨科專業、腎病專業、普通外科專業、產科專業、老年病科專業），是國家藥物臨床試驗機構（10個專業），國家住院醫師規范化培訓基地（22個專業）、云南省繼續醫學教育基地（9個專業），云南省化學中毒救治基地、全科醫師臨床培訓基地、云南省普外基地。醫院的肝膽胰外科、器官移植、燒傷、泌尿、骨科、微創、重癥醫學、康復醫學、神經內科、護理、消化、產科等學科具有突出優勢，步入了國內、省內領先行列，全面提升了醫院的綜合實力及品牌知名度。
　　醫院擁有大型醫療設備200余臺(套)，其中包括全自動生化免疫流水線、3.0T核磁共振成像儀(MRI)、256層CT、SPECT-CT、伽瑪刀頭刀、高壓氧艙等大型先進設備，有力保障了臨床診療水平和醫療安全。
　　教學相長，科研興院。醫院設有臨床醫學、醫學檢驗、康復治療學三個本科專業、15個教研室，有國家級、省級“特色專業”各1個，其中康復治療學專業全部課程通過了世界作業治療聯盟（WFOT）及世界物理治療聯盟（WCPT）國際教育標準認證，為我國內地第一家全部課程通過國際教育標準認證的康復治療學專業。醫院擁有博士學位授權點9個和碩士學位授權點30個，省級“教學名師”3人，校級“教學名師”3人，承擔著昆明醫科大學本科生、研究生的臨床教學、實習和管理工作。醫院還承擔著基層醫院醫師進修學習、全省全科骨干醫生培訓的教學任務、指導幫扶基層醫療機構提高醫療技術水平的任務。
　　醫院現有省級創新團隊2個，先后3次獲得省級科學技術進步類一等獎。醫院共有云南省肝膽胰外科、泌尿外科、燒傷、腦血管病等4個研究所和云南省分子診斷、康復醫學、睡眠呼吸紊亂疾病、肝病、骨質疏松、神經創傷、脊柱側彎與脊柱畸形、創傷外科、婦科宮頸陰道疾病、兒童呼吸系統疾病防治、自身免疫性皮膚疾病、臨床護理、重癥醫學、外科臨床營養等14個研究中心。
　　加強國際交流合作，提高醫院水平及影響力。一直以來，醫院與美國、新加坡、馬來西亞、澳大利亞、瑞典、英國、法國、德國、加拿大、泰國、越南、日本、香港、臺灣等10多個國家和地區的醫療、教學機構建立了廣泛的聯系，有著多層次多方位的醫學研究、人才培養及國際學術交流與合作，先后派出3批援助烏干達醫療隊圓滿完成援外醫療任務。
　　醫院全體干部職工將努力把昆明醫科大學第二附屬醫院建成能與國際交流互動的現代化醫院和高水平的臨床教學基地，為云南省的社會經濟建設、高等醫學教育和衛生事業的發展做出更大的貢獻。