昆明市第三人民醫院成立于1954年1月，是云南省唯一以肝病、艾滋病、結核病等傳染性疾病診治為重點，集醫療、教學、科研、預防、保健、社區衛生服務為一體的大型綜合性醫院。醫院占地165畝，業務用房4萬多平方米，開設床位750張，現有在職人員780名，年門診診療11萬余人次，年收治住院病人1.1萬多人。醫院開設肝病科、結核科、感染性疾病科、關懷科、急診科、內科、外科、婦產科、慢性阻塞性肺病科等19個臨床科室，配備檢驗科、藥械科、放射科、功能科等15個醫技輔助科室，下設吳井路和嚴家地兩個社區衛生服務中心，是“昆明市突發公共事件傳染病救治中心”、昆明醫學院臨床教學醫院。醫院擔負著昆明地區的傳染病臨床診療、預防控制、應急救治、技術指導、人才培訓等工作，業務輻射云南各地，并與歐美、南亞、東南亞地區開展日益廣泛的交流與合作。
　　醫院有市級重點學科3個：肝病重點學科、艾滋病重點學科、結核病重點學科，擁有一批省市知名的傳染病診療專家，肝病、結核病、艾滋病及其它傳染病的診治是醫院傳統的優勢診療項目，技術手段達到省內先進水平。醫院內設市級醫療衛生技術中心5個：“昆明市傳染病臨床檢測中心”，檢測儀器設備先進，質控管理嚴格，能快速準確地檢測甲、乙、丙、丁、戊、庚型肝炎、結核病、艾滋病等相關項目，檢測技術達到國內先進水平；“昆明市艾滋病臨床診療中心”，承擔全市艾滋病防治工作的重要任務，負責管理網絡建設，規范、指導抗病毒治療；“昆明市人工肝治療中心”，治療方法先進，療效確切，在重癥肝病的治療和搶救方面發揮了重要作用；“昆明市慢性阻塞性肺病康復治療中心”，采用中西醫結合治療方法，注重理療康復等手段，對疾病基礎研究全面深入；“昆明市姑息治療中心”，針對疾病晚期病人開展全方位人性化、特色化服務，著力解決病人臨終期的生理、心理、家庭、社會等問題，已形成品牌，發展潛力巨大。
　　隨著城市的擴大，醫院周圍社區居民的增加，醫院從1986年開始成立綜合科室，嚴格按照綜合、傳染兩個病區分開管理。綜合科室內科以呼吸系統疾病和心血管疾病為診治重點，以會員制的形式成立“高血壓之家”,加強門診服務和業務拓展工作。婦產科緊緊以傳染病為依托，開展HBV母嬰阻斷治療和HIV母嬰阻斷治療，阻斷成功率達95％以上。外科通過多年的努力，以普外為主，以傳染性疾病相關外科治療為重點，在滿足周圍社區居民急診和常規手術同時，拓展許多新項目。急診科滿足病人急診服務，24小時接診，并開設綠色通道；ICU科設有層流重癥監護病房，配備精密的監護和搶救儀器，能滿足重癥患者的搶救和治療。關懷科突出臨終關懷特色、人性化服務，為社會人口老齡化背景下，解決老年人及疾病晚期病人護理、臨終關懷問題，提高生存質量和生命尊嚴。“吳井路”和“嚴家地”兩個社區衛生服務中心開展覆蓋周圍社區居民的“六位一體”的衛生服務，開展健康教育，建立居民健康檔案。醫院通過加強綜合科室建設，提高了服務能力，滿足了周邊社區群眾的衛生服務要求，同時對醫院傳染專業水平提升和全院整體業務水平發展提供了強大的支撐。
　　醫院配備有螺旋CT、數字化X光機、進口彩超、結核菌培養儀、流式細胞儀、人工肝機、各型呼吸機、肺功能儀、心電監護儀、各種內鏡（腹腔鏡、支纖鏡、胃鏡、腸鏡、膽道鏡）等先進的檢查及診療設備。優質高效的醫技輔助科室為臨床提供了有力的保障。
半個多世紀以來，春城哪里有傳染病肆虐，哪里就有昆明市第三人民醫院醫護人員的身影。1954年、1964年的麻疹大流行；1957年的猩紅熱大流行；1959年的小兒麻痹大流行；1967年的腦脊髓膜炎大流行；1997年的鼠疫；2003年的SARS；2004年的禽流感；2008年的手足口病；2009年的甲型H1N1流感……一次次與病魔搏斗，一次次與死神抗爭，都留下了市三院醫務人員無畏無懼、堅忍不拔、頑強奮斗的足跡。市三院為保障昆明市乃至云南省人民的身體健康，防控傳染病爆發流行，救治傳染病患者，服務周圍社區居民，維護社會穩定等做出了巨大的貢獻。
　　近年來醫院以構建“專科有優勢，綜合有支撐，服務有特色，管理有效率”的現代化大型綜合性傳染病醫院為目標，結合醫藥衛生改革和現代新昆明建設的要求，進行了一系列卓有成效的改革和建設工作，同時也受到各級政府的扶持和政策傾斜，醫院業務規模日益擴大，綜合服務能力進一步提高，院內環境、基礎設施和就醫流程逐步改善，醫院品牌和社會知名度日益提升。