昆明醫(yī)學(xué)院口腔醫(yī)院前身為創(chuàng)建于1979年的口腔醫(yī)學(xué)系，2001年10月學(xué)校根據(jù)建設(shè)發(fā)展的需要更名為口腔醫(yī)學(xué)院，2004年9月經(jīng)省委省政府和省衛(wèi)生廳批準(zhǔn)，整合第一附屬醫(yī)院6個(gè)口腔臨床科室和第二附屬醫(yī)院口腔科組建昆明醫(yī)學(xué)院附屬口腔醫(yī)院，于2006年10月18日正式掛牌。昆明醫(yī)學(xué)院口腔醫(yī)學(xué)院（醫(yī)院）經(jīng)過(guò)不斷的建設(shè)和發(fā)展，現(xiàn)已成為云南省唯一集教學(xué)、醫(yī)療、科研為一體的口腔醫(yī)學(xué)人才培養(yǎng)基地。
口腔醫(yī)學(xué)院和附屬口腔醫(yī)院目前實(shí)行“兩塊牌子，一套班子”的管理模式，設(shè)有綜合辦公室、工會(huì)、團(tuán)委、學(xué)生辦公室、教學(xué)管理辦公室、財(cái)務(wù)科、醫(yī)護(hù)科、科教科和后勤設(shè)備科等部門(mén)。現(xiàn)有正式在編職工118名，其中教授（主任醫(yī)師）5名，副教授（副主任醫(yī)師）36名，講師（主治醫(yī)師）40名；具有博士學(xué)位者12名，具有碩士學(xué)位者34名。博士生導(dǎo)師1名，碩士生導(dǎo)師21名。外聘職工67名，其中財(cái)務(wù)及管理11名，護(hù)士39名，保衛(wèi)7名，工勤10名。
口腔醫(yī)學(xué)院目前設(shè)有口腔內(nèi)科學(xué)、口腔頜面外科學(xué)、口腔矯形學(xué)、口腔組織病理學(xué)和口腔解剖生理學(xué)等五個(gè)教研室，一個(gè)綜合實(shí)驗(yàn)室和一個(gè)口腔醫(yī)學(xué)研究所，共開(kāi)設(shè)12門(mén)口腔專(zhuān)業(yè)基礎(chǔ)及臨床課程；2001年獲云南省省級(jí)重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科，2005年被云南省評(píng)為省級(jí)重點(diǎn)專(zhuān)業(yè)，2006年口腔臨床醫(yī)學(xué)獲云南省“十一五”建設(shè)規(guī)劃二類(lèi)重點(diǎn)學(xué)科，口腔修復(fù)學(xué)于2006年被評(píng)為云南省精品課程。1986年口腔內(nèi)科學(xué)開(kāi)始招收碩士研究生；1997年獲得口腔臨床醫(yī)學(xué)碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，2002年8月，口腔醫(yī)學(xué)成為一級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)。目前申報(bào)博士點(diǎn)的工作正在進(jìn)行當(dāng)中。
學(xué)院一貫重視科研工作，科研成果喜人。近三年來(lái)共支配科研經(jīng)費(fèi)374萬(wàn)元，年均124.7萬(wàn)元；科研項(xiàng)目獲省部級(jí)獎(jiǎng)共18項(xiàng)，獲發(fā)明專(zhuān)利2項(xiàng)；出版學(xué)術(shù)專(zhuān)著5部；在國(guó)內(nèi)外學(xué)術(shù)刊物發(fā)表論文284篇，其中被SCI收錄11篇；目前承擔(dān)各類(lèi)科研項(xiàng)目36項(xiàng)，其中國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目3項(xiàng)。
昆明醫(yī)學(xué)院口腔醫(yī)院積極倡導(dǎo)國(guó)際交流與合作，多次邀請(qǐng)美國(guó)、加拿大、日本、泰國(guó)、韓國(guó)的專(zhuān)家教授來(lái)我院講學(xué)交流，與日本新瀉大學(xué)、泰國(guó)瑪海多大學(xué)牙學(xué)院、清邁大學(xué)牙學(xué)院建立了友好合作關(guān)系。先后有二十余名教師赴美國(guó)、加拿大、英國(guó)、日本、泰國(guó)進(jìn)修學(xué)習(xí)。2004年作為中國(guó)唯一代表加入湄公河區(qū)域國(guó)際牙科協(xié)作組織(IDCMR)，并于2006年10月18日口腔醫(yī)院建成揭牌之時(shí)承辦了“第三屆湄公河流域口腔醫(yī)學(xué)協(xié)作組織學(xué)術(shù)交流會(huì)”；2006年8月承辦了全國(guó)“牙周病檢查診斷及治療的規(guī)范化評(píng)估”培訓(xùn)班。近三年中，共二十余名研究生和本科生被選派赴泰國(guó)和北京等地參加國(guó)際學(xué)術(shù)交流活動(dòng)。