黃岡市第二人民醫院由蘄州分部和黃州分部組成，其中蘄州分部地處大別山南麓，坐落在偉大的醫藥學家李時珍的故鄉――蘄州城內鳳凰山腳下，距李時珍陵園約4華里，占地面積160余畝，是一所綜合性的市級醫院。

黃岡市第二人民醫院創建于上世紀50年代。1951年6月，“抗美援朝”戰爭爆發，湖北省人民政府接到中央關于收治志愿軍傷員的指示，經省人民政府委員會主席李先念批示，決定在黃岡、大冶、孝感、襄陽、洪湖分別組建志愿軍休養院。5月下旬黃岡專員公署根據指示，決定將院址設在蘄州城內原天主教堂及教會辦的啟明中學內。設病床400張。1951年7月1日,“中國人民志愿軍湖北省黃岡休養院”正式成立。隸屬湖北省人民政府志愿軍休養院管理委員會領導。

1953年，大冶、襄陽、孝感三所志愿軍休養院撤銷，黃岡休養院改名為“湖北省衛生廳第二康復醫院”，設病床500張，隸屬衛生廳康復醫院管理局領導。咸寧原第67軍預備醫院改為省第一康復醫院，洪湖為第三康復醫院。

1955年2月21日，經省人民政府批準，撤銷第一和第三康復醫院。第二康復醫院改為“湖北省衛生廳康復醫院”，設病床500張，隸屬省衛生廳領導。

1958年1月，醫院劃歸黃岡專員公署領導，改名為“湖北省黃岡專員公署康復醫院”，接收黃岡公署地方干部住院休養。

1973年3月14日，醫院更名為“黃岡地區第二人民醫院”。

1977年11月，經湖北省革委會批準，建立“湖北醫學院黃岡分院，校址設在黃岡地區第二人民醫院，實行院校合一，黨委領導體制，醫院職能相應變為教學醫院”。

黃州分部地處黃州高新技術開發區，創建于1992年，先后總投入3000多萬元,占地面積2萬余?，承擔黃岡市公共衛生疾病的防治工作,為黃岡市傳染病醫院所在地。

黃岡市第二人民醫院目前開設內科、外科、兒科、婦科、口腔科、耳鼻喉科、麻醉科、疼痛科、中醫科、康復科、皮膚性病科等臨床科室，以及檢驗科、放射科、胃鏡室、病理室、B超室、心電圖室、CT室等醫技科室，醫院醫療設備先進，配套齊全，現擁有美國GE9800型CT機、德國西門子G60S彩色多普勒超聲檢查儀、日本B超、彩色腦地形圖機、日本奧林巴斯GIFV70電子胃鏡、西門子500毫安雙球管X光機、多功能麻醉機、高頻電刀、臭氧離子空氣消毒機、KD200B1型呼吸機、美國雅培全自動血液分析儀、自動生化分析儀、美國IRMA血氣分析儀、優利特尿液分析儀、日本東亞KX―21N血球計數儀、洗胃機、TMQ－CVK型臺式滅菌器、ZC9200A型全電腦連體式牙科綜合治療機、早產兒培養箱、XHZ―90型新生兒黃疸治療儀、二氧化碳激光治療儀、PC―8000產科監護儀器、日本磁力溫熱振動治療儀等先進設備，并擁有一批高學歷、高年資、臨床經驗豐富的專家及青年技術骨干，形成了獨具特色的綜合性質醫院。