復旦大學附屬兒科醫院廈門分院（廈門市兒童醫院）系廈門市衛生和計劃生育委員會管理的全民事業單位，是廈門市委、市政府重大民生工程建設項目，建設發展目標是建成集醫療、教學、科研、預防保健為一體的海峽西岸一流的三級甲等兒童專科醫院。醫院由復旦大學附屬兒科醫院負責管理。

　　醫院位于廈門市湖里區宜賓路92-98號，建筑面積7.39萬平方米，編制床位500張，2014年6月1日開始運營。醫院專業設置齊全，重點科室有NICU、PICU、新生兒科、小兒呼吸內科、小兒消化內科、小兒神經內科、小兒心血管科、中醫兒科、新生兒外科、小兒普外科、小兒骨科、小兒泌尿外科、兒童保健中心、康復醫學中心等，配有先進的潔凈手術室。醫院將擁有現代化醫療設備，包括磁共振、64排菲利普微平板CT、彩色超聲診斷儀、24小時動態腦電圖、電子胃鏡、腹腔鏡、嬰幼兒肺功能儀、化學發光儀、特定蛋白測試儀、流式細胞儀、德國布魯克微生物質譜儀等先進診療設備。

　　醫院海納了國內外兒科領域的多名專家任學科帶頭人，技術力量雄厚。復旦大學附屬兒科醫院對廈門分院實現品牌、管理和技術的平移。兩院之間專家互訪，建立統一的門診工作平臺，開通遠程會診平臺，對疑難病例及時會診轉診，實現無縫對接。醫院秉承“一切為了孩子”的服務理念，努力為兒童提供有效、快捷、安全、方便的醫療保健服務。