南京軍區福州總醫院（原九三醫院）又稱東方醫院，建于1949年8月，是一家具有光榮歷史的醫院。經過半個多世紀的建設和發展，已成為學科齊全，技術力量雄厚，設備先進，診療環境優良，集預防、醫療、保健、教學、科研為一體的大型綜合性"三級甲等醫院"。醫院是國家衛生部國際緊急救援網絡醫院、福建省"120"醫療急救網絡醫院、省交通事故救治定點單位以及省、市醫保首批定點醫療機構。
醫院由院本部、第二住院部、莆田95臨床部、寧德442臨床部、福州476臨床部組成。醫院院本部位于福州市西側，毗鄰西湖、左海公園，交通便捷，依山傍水、綠樹成蔭、空氣新鮮、鳥語花香，是全軍"文明衛生營院"和"園林式營院"以及福建省"福建省花園式單位"、"福建省衛生先進單位"、“福建省綠化環保先進單位”。
醫院院本部占地面積38萬平方米（570畝），醫療用房面積10多萬平方米。醫院院本部展開床位2000張，年門診量達近140萬人次、年住院量5萬余人次，年手術量2萬多臺次。醫院技術力量雄厚，擁有高級技術職稱專家近300名，具有博士、碩士學位者200多名，在國家、軍隊及省級擔任學術職務320多人次，其中領軍人才3人，全軍級學科帶頭人9人，軍區級、省級學科帶頭人40多人。
醫院擁有國內領先的醫療、教學、科研設備，設備總值近6億元，主要有PET-CT、磁共振儀4臺、高速CT2臺、全身γ-刀、ECT、DSA、數字胃腸機（DR）、數字拍片機（CR）、頭顱X-刀、直線加速器、流式細胞儀、電子顯微鏡、大型彩色多普勒儀、電子胃腸鏡、自動麻醉機、體外震波碎石機、高壓氧艙群、全層流凈化手術室等。
醫院院本部設有53個專業學科，擁有1個國家級重點學科：國家中醫藥管理局腫瘤重點學科；7個全軍級重點學科：全軍臨床檢驗醫學研究所、全軍器官移植中心、全軍兒科疾病診治中心、全軍計劃生育優生優育研究所、全軍臨床藥理基地、全軍醫院信息化研究與技術支持基地、全軍衛生音像制作中心；12個南京軍區重點學科：軍區普通外科研究所、肝膽外科研究所、骨科研究所、婦產科研究所、呼吸內科中心、消化內科中心、腎臟病中心、神經外科中心、腫瘤中心、中醫中心、藥學中心、病理診斷中心。2006年以來，在全軍器官移植中心學科群組建成功的基礎上，已先后組建了普外消化病中心、肝膽病中心、骨科研究所、腦科中心、醫學影像中心、腫瘤放射治療中心六個重點學科群。
器官移植是醫院的主要特色，已先后開展腎臟、肝臟、肝-胰-腎、肝-腎、胰-腎、心臟、心肺、肺臟、角膜、骨髓、干細胞等移植，手術的種類、數量和質量居國內領先水平，成為國內重要的大型器官移植中心之一。同時，醫院在腎臟病、肝膽疾病、女性尿失禁、脊柱疾病、顱腦疾病、老年病、心腦血管病、消化病、腫瘤等疾病診治方面處于國內先進水平。醫院開展的臨床檢驗技術、血液凈化技術、放射介入技術、病理診斷技術、微創技術、超聲診治技術等處于軍內外、省內外先進水平。
醫院設有國家人事部博士后科研工作站，擁有7個博士后帶教學科。醫院是廈門大學附屬東方醫院，第二軍醫大學、南方醫科大學、福建醫科大學臨床醫學院，第四軍醫大學、安徽醫科大學、南昌大學醫學院教學醫院。有33個學科（專業）點與上述高校及福建中醫學院等聯合培養博士、碩士研究生，擁有博士、碩士研究生導師80名。此外，醫院每年還承擔上述高校及其它高校近600名本科生臨床大課、臨床見習、臨床實習教學任務，每年接收軍內外進修生200余人次。　　
醫院科研能力較強、研究水平較高。目前，醫院承擔了國家、軍隊和福建省科研項目150多項，其中重大項目近10項，還承擔了160余項院內科研項目。多個研究項目有望取得重大突破。"十五"以來，醫院獲國家、軍隊科技進步、醫療成果獎和福建省科學技術獎165項，其中國家科技進步二等獎2項，軍隊醫療成果一等獎1項、軍隊科技、醫療成果二等獎16項，福建省科學技術一等獎4項、二等獎24項。在國內外期刊上發表學術論文5500余篇，出版專著30多部。　　
醫院重視科學化管理工作，1998年以來，醫院建立了以信息技術開發和推廣應用為主要內容的國家金衛工程"軍字一號"，有25臺服務器、2000多個計算機工作站聯網并正常運行，使全院日常醫療、護理、教學、辦公實現數字化。各類信息系統，如醫院信息系統（HIS）、醫學圖像傳輸與存貯系統（PACS）、臨床檢驗信息系統（LIS）、麻醉信息系統、心電監護系統、心電圖信息系統、辦公自動化系統（OA）均實現無縫聯接，初步建成數字化醫院。醫院是全軍五家數字化醫院及全國二十家數字化醫院試點示范單位之一。
醫院重視全面建設，堅持正確的辦院方針，樹立"以病人為中心"的服務理念，堅持為部隊服務方向，將"團結、奮進、德高、技精"作為院訓，以質量效率為基礎、科技為先導，大膽改革、開拓創新，嚴格執行醫療護理等各項規章制度，不斷完善質量管理體系，極大地促進了醫療護理服務質量的提高。醫院注重醫德醫風建設，開展了讓病人"方便、放心、滿意"等活動，并全面實施整體護理與健康教育工作，不斷拓寬服務項目、深化服務內涵，密切了醫患、護患關系，涌現了一批軍中白求恩-溫端生、榮獲一等功的優秀保健醫生孟衛平主任”式的白衣戰士，他們以精湛的技術、優良的服務，熱忱為國內外來院就診人員服務，獲得了廣泛贊譽。醫院已連續三次六年被評為全軍為部隊服務先進醫院。2006年，被總政、總后聯合表彰為全軍先進醫院。
今后，醫院將按照科學發展觀的要求，加強學科、人才、技術建設，不斷提高科學化管理水平、不斷提高醫療護理質量，以最精湛的技術、最優質的服務、最大的誠意為廣大患者服務，為推動我國醫療衛生水平的提高、促進人類健康、促進社會進步作出自己更大貢獻。