福建省腫瘤醫院于1979年籌建，1981年正式破土動工，1984年7月開始收治部份病人，1986年11月12日正式掛牌開院。2001年11月成立福建省腫瘤研究所。占地148畝，建筑面積9萬多平方米，醫療用房8萬多平方米。編制床位1000張，實有床位1026張。實際開放床位1300張（含加床、日間治療）。人員編制1298人，現有職工1037人，臨時聘用工400人，離退休152人。衛生技術人員831人，其中正高職稱48人，副高職稱111人，中級職稱283人，博士、碩士91人，教授、副教授22人，博士、碩士生導師25人，享受國務院特殊津貼專家5人。
　　福建省腫瘤醫院是全省唯一的一所集腫瘤預防、治療、科研、教學、培訓于一體的省級腫瘤專科醫院，1997年7月被國家衛生部評為三級甲等腫瘤醫院，2007年8月通過省衛生廳三甲醫院復審。是省內唯一具備腫瘤綜合治療體系的醫療機構，具有外科手術、放射治療、內科化療、干細胞移植治療、中西醫結合治療及生物治療：CIK治療和DC-CIK治療技術。2001年起成立了乳腺癌、消化道癌、肺癌、肝癌、惡性淋巴瘤、婦科腫瘤等6個綜合治療專家小組，強調規范腫瘤綜合治療，提高了腫瘤病人的治愈好轉率和生活質量，延長了生存期，保持了腫瘤診療技術在省內領先和國內的先進水平。
　　福建省腫瘤醫院與美國、法國的癌癥中心以及國內北京、上海、天津、廣州等腫瘤醫院以及福建醫大合作，培養在職研究生，取得成效。近年來，完成科研課題64項，其中省科委21項，衛生廳43項，獲科技成果獎40項。發表醫學論文2000多篇。主編出版了《福建省惡性腫瘤地圖集》、《常見惡性腫瘤病理組織學與免疫組織化學彩色圖譜》等5部專著。舉辦了“近距離放射治療國際會議”、“全國腫瘤化療學習班”、“中法放射物理學術研討會”、“國際現代放射腫瘤學新進展學術研討會”、“第九屆全國肝癌學術會議”、“第四屆全國近距離放射治療學術會議”、“第二屆全國腫瘤護理學術會議”、“全國食管癌三野根治術學習班”、“第十屆全國肺癌學術大會”、“惡性腫瘤腔鏡外科論壇”、“第三屆泛珠江區域放射腫瘤學大會和第一屆海峽兩岸放射腫瘤學會議”等近50次國際和全國腫瘤學術研討會，在國內外同行中的知名度有了很大提高。
　　福建省腫瘤醫院2000—2006年，連續3屆評為省直“文明單位”，2006年11月，被福建省省委、省政府評為2003－2005年度福建省“文明單位”，2006年11月，被省衛生廳評為“2005－2006年度福建省衛生系統救災防病先進集體”，2008年，被中央文明委評為“全國精神文明建設先進單位”。