湖州市雙林人民醫院創建于1952年11月，前身雙林衛生所（1952年11月建），歷經變更稱雙林區衛生所（1953.5）、雙林人民公社醫院（1959.1），1961年11月吳興縣人委將醫院定為縣級人民醫院，醫院名稱經多次更改為：吳興縣第三人民醫院、雙林防治醫院、湖州市第四人民醫院，1983年改為湖州市雙林人民醫院，南潯區機構編制委員會【2012】27號文件，更名為湖州市南潯區雙林人民醫院。
1999年5月，雙林鎮衛生院（原名苕南衛生院）并入。2000年1月，莫蓉鄉衛生院、鎮西鄉衛生院并入。
經過六十多年的艱苦創業，不斷發展壯大，改革開放以來，醫院堅持“以病人為中心、以質量為核心”的辦院宗旨，在競爭中求發展，開拓中求創新，管理中求提高，逐步發展成為一所集醫療、預防、教學、科研、社區服務為一體的國家二級綜合性醫院。
1996年被世界衛生組織、衛生部授予“愛嬰醫院”榮譽稱號；1998年被授予“區級文明單位”稱號；1999年榮獲浙江省衛生系統“思想政治工作先進集體”；2005年11月被浙江省衛生廳評定為國家二級乙等醫院；2006年1月被中共湖州市委、市人民政府授予“市級文明單位”稱號；2007年被省衛生廳、省環保局評定為“綠色醫院”；2008年9月通過了創建省級“平安醫院”的評審；2008年12月被省愛國衛生運動委員會評定為“省級衛生先進單位”。；2012年被定為浙江省住院醫師規范化全科醫療培訓基地。
醫院目前總資產4260余萬元。2002年5月已投入使用的新醫院，主樓住院部大樓六層、門診大樓五層、醫技大樓三層，占地面積51畝，醫療用房建筑面積15456平方米，綠化面積20余畝。醫院環境優雅，寬闊的人行道兩側綠草茵茵，院內有假山、亭閣、綠地，有利于病人早日康復，病室舒適寬敞清潔，各種通信、供氧、生活設施均符合現代醫院的要求。
醫療設備：目前擁有日立全身螺旋CT、富士CR、DR、500MA遙控X線電視透視系統、C型臂X光機、拍片機、百勝彩超、24小時動態心電圖、史賽克腹腔鏡、奧林巴斯內窺鏡（胃鏡、腸鏡）、奧林巴斯AU680全自動生化儀、酶標儀、全自動血球計數儀、同光路手術顯微鏡、麻醉機、無創呼吸機、多功能電動手術床等價值千萬余元的高級醫療儀器。
信息化建設：醫院信息化建設自2002年起，緊緊圍繞省衛生系統信息化建設的目標，結合醫院發展的實際需要，目前已初具規模，擁有HIS、LIS、PACS、EMR、醫保、新農醫等各大主系統，主要功能涵蓋全院，子系統包括：門急診掛號收費、出入院結算、中西藥房、醫生診間、醫技檢查、檢驗、住院醫生護士工作站、財務統計、設備總務、病案管理等，各系統之間均已打通，實現全院數據共享，能基本滿足臨床工作及行政管理的需要。特別是，通過這幾年的建設實踐，積累了經驗，鍛煉了隊伍，為實現數字化醫院奠定了一定的基礎。
醫院現有在職職工284名（其中在編職工195人，退休返聘同志21人，合同工68人）。專業技術人員260名，其中高、中級技術職稱100余人。現有退休人員141人。
開放床位140張，設六個病區，門診科室23個，醫技輔助科室齊全。2014年門診量286726人次，出院人數9328人次，總收入8057.5萬元，醫療收入8057萬元。
醫院技術力量雄厚，無痛胃鏡檢查、腸鏡檢查，腹腔鏡手術在全區處于領先水平。近五年來，開展新技術新項目50余項，在省級專業期刊上發表論文40篇，國家級專業期刊上發表論文3篇。