南京市胸科醫(yī)院建于1950年，是江蘇省規(guī)模最大的胸部專科醫(yī)院，承擔著省、市胸部疾病的醫(yī)療、教學(xué)、科研任務(wù)。是"東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院教學(xué)醫(yī)院"、"南京肺灌洗中心"、"南京市結(jié)核病研究所"。2003年與澳大利亞阿爾弗雷德醫(yī)院建立友好醫(yī)院及科研技術(shù)合作伙伴關(guān)系，2004年成功地為兩例終末期慢性阻塞性肺病患者實施了單肺移植、對側(cè)肺減容術(shù)，填補了南京地區(qū)人體肺移植技術(shù)的空白。2005年加入鼓醫(yī)集團后，

　　與鼓樓醫(yī)院胸心外科聯(lián)合成立了"鼓醫(yī)集團心血管病中心"。2006年已申報肺癌診治中心。醫(yī)院在胸部疾病的診斷、治療等方面，具有較高的專科水平而享譽省內(nèi)外。

　　目前醫(yī)院擁有編制床位500張，設(shè)有胸外科、呼吸內(nèi)科、結(jié)核病科、心血管內(nèi)科、心臟外科、麻醉科、放療科、中西醫(yī)結(jié)合科、急救中心等11個臨床科室，其中胸外科為南京市重點專科；設(shè)有醫(yī)學(xué)影像科、檢驗科、病理科、心導(dǎo)管室、氣管鏡室等10個醫(yī)技科室；另有中心實驗室、胸心外科研究室、胸部腫瘤研究室、肺結(jié)核病研究室等。隨著醫(yī)院新病房大樓的建成和使用，業(yè)務(wù)和床位將會進一步得到拓展。

　　醫(yī)院現(xiàn)有醫(yī)療設(shè)備1030臺（件），總價值4500多萬元。主要醫(yī)療設(shè)備有：鈷-60治療機、模擬定位機、螺旋CT機、胸腔鏡、縱隔鏡、DSA、主動脈內(nèi)球囊反博泵、數(shù)字化胸片機、結(jié)核桿菌快速培養(yǎng)儀、動態(tài)心電圖、麻醉機、呼吸機、肺功能機、彩色多普勒診斷儀、全自動系列生化分析儀、血氣分析儀、移動式X線機和ICU中央監(jiān)護設(shè)備等。
　　醫(yī)院科研工作生機勃勃，成績斐然。共獲國家、省、市、局科研成果獎近60項.在市級以上雜志發(fā)表學(xué)術(shù)論文600多篇，參加國際性學(xué)術(shù)會議10多次。

　　醫(yī)院是南京市"花園式單位"和"花園式醫(yī)院"，醫(yī)院多次被南京市政府、江蘇省衛(wèi)生廳、南京市衛(wèi)生局授予"文明單位"、"文明醫(yī)院"、"先進基層黨組織"等光榮稱號。