蘇州中醫院創建于1956年，建院后匯集了黃一峰、陳明善、奚鳳霖等一大批名老中醫。目前我院擁有一批省、市名中醫、名中西醫結合專家。經過四十多年的發展，現已成為一所醫療、教學、科研相結?的綜合性中醫?。目前是全國示范中醫醫院和三級甲等中醫院、南京中醫藥大學附屬醫院、南京中醫藥大學教學醫院、上海中醫藥大學聯合培養研究生基地。蘇州市中醫藥研究所、蘇州市中醫學會、蘇州市中西醫學會、蘇州中醫藥博物館設于本院。
蘇州市中醫醫院有主任醫（藥）師28名，副主任醫（藥）師83名，主治醫（藥）師223名，兼職博士生導師2名，兼職教授、副教授72名（其中教授22名、副教授50名），講師19名，具有本、專科畢業學歷的醫師225名（其中本科142名、專科83名），占醫師總數的的95％以上。醫院有博士7名，碩士47名。臨床一級科室設有內科、外科、肛腸科、急診科、骨傷科、針灸科、婦科、兒科、推拿科、皮膚科、耳鼻喉科、眼科、口腔科、調養服務中心共十四個。臨床二級科室設有消化內科、腎內科、腫瘤科、心血管內科、內分泌科、呼吸科、風濕科、血液內科、神經內科、中醫整骨、創傷、脊柱、關節病、關節鏡、泌尿科、男性科、腦外科、瘡瘍科、乳房病、麻醉科。門診開設具有中醫特色的專病專科30個。其它業務科室有：放射科（含ＣＴ室）、檢驗科、病理科、功能檢、查科（超聲波、內窺鏡、心電圖、24小時動態心電圖）、藥劑科、消毒供應室、手術室、麻醉科、營養室、圖書館、病案統計室、信息科、中醫藥研究所等。
目前，蘇州市中醫醫院骨傷科為國家中醫重點臨床專科；中醫婦科不孕癥專病被國家中醫藥管理局批準為國家中醫重點臨床專科（專病）協作組單位；消化科被列為國家中醫重點臨床專科建設單位；呼吸內科被列為省中醫重點臨床專科建設單位；肛腸科、針灸科是市中醫重點臨床專科。
蘇州市中醫醫院先后與美國、日本、新加坡、加拿大、澳大利亞、德國等進行了交流與合作，并與日本前田中國醫學研究院形成了長期交流關系。在新加坡開設了合作診所。蘇州中醫藥事業越來越成為蘇州對外交流的橋梁和紐帶。
隨著醫院的不斷發展，經多方考證，由于醫院處于古城鬧市區，交通擁堵，現已不能適應蘇州經濟建設發展的需要，也難以滿足廣大人民群眾對中醫服務的需求。為了振興中醫藥學，弘揚吳門醫派，保護古城，蘇州市委、市政府堅持“以人為本”的執政理念，決定實施中醫院遷建工程。而醫院原址繼續辦好中醫藥博物館，宣傳吳門醫派文化特色；保留市區名老中醫高級專家門診；保留制劑大樓，繼續自制產品的生產。新建成的蘇州市中醫醫院位于滄浪新城內友新高架、吳中西路之南側，西鄰新郭路，南接楊素路，北靠吳中西路，占地面積38792平方米，并建有中藥植物園，依山傍水，交通便捷，環境幽雅。新建醫院總建筑面積90萬平方米，將擁有580張床位，年門、急診量達80萬人次以上。將提供門、急診醫療服務和住院醫療服務，滿足蘇州城區以及周邊地區群眾的醫療需求。并以各種傳統自然療法為手段，提供以中醫中藥為主的特需醫療服務，滿足市民不同層次的需求。加強急診、急救體系建設，適應新建醫院所在地區群眾的需求。建立設施先進的教學基地，開展各科后期臨床課程教學、碩士及博士研究生教學、臨床實習教學、員工的繼續教育、進修人員培訓等教學工作。進一步開展國家新藥Ⅰ期臨床、Ⅱ期臨床研究工作。屆時，蘇州市中醫醫院將是一所科室齊全、管理科學、服務設施一流的現代化大型綜合性中醫醫院，醫院服務功能將進一步完善，進一步繼承吳門醫派特色優勢，為人民群眾提供更優質的醫療服務。