巨鹿縣醫院始建于1948年，歷經三次搬遷，于2002年6月遷于現址，占地38000平方米，建筑面積16000平方米，設置病床260張，經過50多年的建設，已發展成為集醫療，教學，科研，預防，保健為一體的國家二級甲等綜合醫院。

巨鹿縣醫院目前床位260張，設立9個病區，13個專業科室擁有巨鹿縣急救中心，孕產婦危重癥搶救中心，司法醫學鑒定中心。是我縣唯一的一家住院醫師規范化培訓基地，并分別被河北工程大學醫學部，邢臺醫專確定為臨床教學醫院。先后與中國人民解放軍第二炮兵總醫院，河北省兒童醫院，北京軍區總醫院確立技術協作醫院關系，每月定期來專家坐診。在設備建設上，醫院近年來加快了現代化建設的步伐，相繼引進了美國GE公司全身螺旋CT，CR，C形臂，大型彩超，日本奧林巴斯電子胃鏡，結腸鏡，德國腹腔鏡，百康生物共振過敏檢測治療系統，鈷-60，全自動生化分析儀等高精尖醫療設備。2003年開設了洗衣房，增設被服和中心供氧，中心吸引，全院實行微機化管理，設備總投資達到了1000多萬元。

巨鹿縣醫院采取多項舉措減輕患者負擔，方便患者就醫，足不出縣就可享受到上級知名專家的診治，受到社會的廣泛好評。每月初六化驗肝功能，乙肝五項，尿十項，血脂，血糖只收半費；每月農歷十六“孕婦學校”，當日B超，彩超檢查半費；孕產婦住院免費接送；每月初六河北省兒童醫院派專家坐診；每月公歷8-9號上午北京第二炮兵總醫院派腦外，胸外，肛腸，耳鼻喉科專家坐診；每月公歷10-12號北京肝病專家（乙肝）朱寅生來我院坐診；每月公歷18-19號上午北京軍區總醫院派專家坐診；每周日原邢臺市人民醫院副院長方占贏來內三科，病理室坐診；每月邢臺眼科醫院專家主導白內障超聲乳化人工晶體植入術。以“大綜合小專科”做為學科發展的宗旨，醫院根據當地的醫療資源合理配置，重點發展。1992年建設了骨科，兒科心血管內科，神經內科四個專業學科；2002年建設了神經外科，胸外科，泌尿外科，肝膽外科四個專業學科，2004年成立了腫瘤內科。其中骨科被批準為市級重點專科，兒科的《新生兒缺血缺氧性腦病及后遺癥》科研課題被列為省級繼續醫學教育項目。

巨鹿縣醫院領導高度重視醫院的文化建設，相繼開展了愛國，愛院，以病人為中心，為病人獻愛心活動，采用讀書知識競賽，文藝演出，下鄉街頭義診，健康宣傳等形式，大力弘揚正氣提高職工的政治思想素質。2003年聘請法律專家，禮儀專家到醫院講課，全員培訓，大大提高了職工的法律意識和文明禮貌意識，使醫院呈現出人人講學習，人人講禮貌，人人努力工作蒸蒸日上的良好勢頭。2004年，出院病人達到了11500人次，手術超過2000臺次，門診量突破10萬人次。業務量，業務收入雙增30%，比2001年翻了一翻。

巨鹿縣醫院根據醫院的發展需要，在縣委，縣政府的大力支持下，醫院領導決定投資3500余元建設一棟10層高標準外科住院樓，建筑面積18600平方米，2007年12月投入使用。嚴謹，求實，創新，發展的巨醫人，以精湛的技術，精心的服務，精良的設備，做為醫院的核心競爭力，傾力打造邢臺市東部醫療中心，爭創我市乃至河北省一流縣級醫院。