鸚鵡熱衣原體肺炎是一個較早發現的肺疾病(17世紀末)，那時認為鸚鵡是該病原體的宿主而將其引起的疾病稱為鸚鵡熱衣原體肺炎。鸚鵡熱衣原體肺炎潛伏期為1-2周。臨床癥狀可以是輕度的或一過性的流感樣癥狀，也可以是急性發病，伴有高熱，劇烈的頭痛和肺炎。鸚鵡熱衣原體肺炎的臨床表現類似肺炎衣原體肺炎，開始有發熱、寒戰、頭痛、出汗和許多其他常見的全身和呼吸道癥狀，如不適、關節痛、肌痛、咯血和咽炎。鸚鵡熱衣原體肺炎應注意與肺炎衣原體、肺炎支原體、立克次體、嗜肺軍團菌、某些病毒和真菌引起的肺炎相鑒別。